下载Autodock以及AutoDockTools
http://autodock.scripps.edu/
http://autodock.scripps.edu/downloads/resources/adt/index_html
下载蛋白质结构
蛋白质三级结构预测软件
www.swissmodel.expasy.org
Open babel软件可以各种蛋白格式的转换以及多个分子的mol2文件拆解
安装Python
安装PyMOL软件，对蛋白预处理，去水、加氢，导出为PDBQT受体文件
教育用途PYMol的注册https://pymol.org/edu/?q=educational
蛋白结构修复
口袋预测
Chimera软件打开口袋预测文件
小分子化合物库
小分子用Autodock加氢导出为pdbqt
Autodock设置盒子大小。
PyRx软件用于虚拟筛选有GUI
Vina也可虚拟筛选但是没有GUI界面，但是预测更准确
