个人学习笔记不一定正确，如有错误的地方请大家指正，谢谢。
Schrodinger
蛋白文件的导入可以从File-Import Structures中导入文件，也可以使用File中的Get PDB输入PDB号自动下载（需联网）。
蛋白质准备：Protein Preparation
上述每执行一步之后左侧列表区都会出现这个流程处理后的最新蛋白结构。
配体准备：LigPrep
配体准备是为了下一步与蛋白质对接，如果非常多的配体可以不用这个程序，耗时间，30万配体，双路E5-2603处理器共32线程需要运行35小时左右。
使用Virtual Screening Workflow程序可以批量进行HTVS-SP-XP三轮精度递进的对接，并且程序中有Prepare ligands选项，勾选即可。
设置对接盒子：Receptor Grid Generation
选择某个配体，可以自动生成盒子，并且在对接过程中会去掉配体。
如果没有配体在第二个选项卡site中可以设置参数。
筛选：Ligand Docking
